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原料来源瓶颈问题：
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海洋环境，资源的可持续性获得，海洋药物原料种类来源单一，获得的物质种类范围有限，因而导致生物活性筛选范围受限。海洋药物原料来源受限，严重制约了海洋药物的研发进度，导致相关药物研发战线长、耗资高、进展缓慢。产业结构：区别于其他药物以企业为主的研发主体，我国乃至世界的海洋药物研发的主体为高校与科研院所，造成海洋药物的开发与企业产业化脱节严重，与市场需求结合不够紧密，海洋药物的筛选和研发与市场下游环节脱节严重，导致国内外已有的海洋药物适应症与非海洋药物重叠严重。
资本投入有限：海洋生物医药产业领域资本活跃度较低，近年来仅有海济生物等寥寥数起融资，资金的主要来源是政府经费和企业的科技活动借贷款，资金来源渠道较为单一。
技术要求高，投入大：海洋来源的药物资源种类丰富，但是分散度高，难以富集，物质结构复杂，原料收集与纯化成本高昂；药物研发在产业化之前步骤，需要具有一定批量的原料进行成药性研究，因此成本高昂的海洋药物原料及高技术要求，严重地制约了海洋药物的发展
政策：近年来海洋生物医药产业的发展已经上升到国家战略高度，《国民经济和社会发展第十四个五年规划和2035年远景目标纲要》提出“积极拓展海洋经济发展空间”的战略部署，建设现代海洋产业体系，培育壮大海洋生物医药产业；《“十四五”海洋经济发展规划》则提出以深化供给侧结构性改革为主线，以改革创新为根本动力，加快构建现代海洋产业体系，着力提升海洋科技自主创新能力。在国家战略的引领下，各地相继出台十四五期间的海洋经济发展规划，结合自身发展实际细化海洋生物医药产业的发展方向。
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