《办法》规定，市场应当设立负责食品安全的管理部门或配备食品安全管理人员，监控本市场的食品安全状况。市场应当对入市经营的食品索证索票，依法查验食品供货者及食品安全的有效证明文件，留存相关票证文件的复印件备查。同时，市场还应建立不合格食品退市制度。对有关行政主管部门公布的不合格食品，市场应当立即停止销售，并记录在案。
《办法》鼓励市场申请绿色市场认证，并使用相应的认证标志；禁止冒用、使用伪造的前款规定的认证标志。市场现场制作销售食品应当具备保障食品安全的设施设备和条件，远离污染源，并应在消费者可视范围内操作。
在市场监管方面，《办法》要求商务主管部门建立市场巡查制度，定期和不定期对市场和经销商实施的食品安全管理状况进行检查。
《办法》还对食品流通管理作出了处罚规定：对违反相关条款者，由商务主管部门予以警告，责令限期改正。逾期不改正的，可处3万元以下罚款。
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