《规划》提出了具体指标，到“十一五”末期，食品安全保障体系基本建立。包括：食品安全信息监测覆盖面达到90%；大中城市批发市场、大型农贸市场和连锁超市的鲜活农产品抽检质量安全合格率达到95%；重大食品安全事故处理率达到100%；食品召回覆盖面达到80%，食品生产企业全国专项检查覆盖面达到90%。到“十一五”末期，农村药品监督网覆盖率达到100%，农村药品供应网覆盖率保持在80%以上；对于现有国家药品标准的独立全项检验能力，省级药品检验机构和口岸药品检验机构达到100%；市(地)级药品检验机构达到80%；国家级医疗器械检验机构对归口产品检验能力达到100%，省级医疗器械检验机构对市场常规产品检验能力达到95%以上；药品监督抽验覆盖面由现在的30%提高到80%。
《规划》还部署了“十一五”期间食品药品安全工作的18项主要任务，包括加强食品安全监测；提升食品安全检验检测水平；完善食品安全相关标准；构建食品安全信息体系等。
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