超市自制食品尚无卫生安全标准可遵循。目前超市执行的是由卫生部颁布的《散装食品卫生管理规范》，对于超市自制食品的生产销售，这个《规范》并未提出具体的卫生标准，这使得主要依靠手工制作或现场加工的自制食品存在管理上的空白。就拿食品保质期来说，由于每家超市的商品保存条件不同，保质天数也不尽相同，设定无法统一，因此即使是相同产品，每家超市的规定也千差万别。
即将出台的《超市现场加工食品经营规范》要求超市自制食品的全部原辅材料、包装材料均应达到国家相关标准，同时还对过期食品的处理、食品保质期作出了新的规定。另外，《规范》对超市的柜台环境等作出明确规定，由于不少超市内都是出租柜台经营自制食品，在管理上存在漏洞，对此《规范》指出，对联营专柜商户的管理应视同超市内部管理。
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