2008年，该县通过与西南大学县校合作的方式，成立了“重庆市石柱县辣椒研究中心”，对辣椒生产和加工进行指导研究，为该县辣椒产业发展壮大起到了有力的推动作用。
“农业科技综合示范基地创新基金”项目主要由西南大学植保学院负责。通过在该县龙沙镇长坪村和油坊村建立130亩示范基地，针对辣椒病虫害预警与综合防治，采取一系列调控措施平衡土壤和辣椒生长期营养，以达到辣椒生长的保健作用，提高该县辣椒生产的质量和单产效益。
“辣椒降血脂减肥保健食品研究”科研项目，主要由西南大学食品科学院负责。项目依托该县丰富的辣椒资源，深入研究辣椒在对人类健康方面的保健作用。
“农业科技综合示范基地创新基金”和“辣椒降血脂减肥保健食品研究”两大科研合作项目，将为该县辣椒加工业带来新机遇，加快该县“全国辣椒产业第一县”建设步伐。
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