检查发现，一些食品生产经营及相关企业还没有按照法律的要求落实食品安全责任，严格执行食品安全生产规范，健全从业人员健康管理、产品召回、索证索票方面的制度；食品行业协会等自律组织在推进行业诚信建设、促进和引导食品产业健康发展方面的作用还有待进一步发挥；有的地方还没有处理好加强食品安全工作与发展食品产业的关系。
执法检查组建议，国务院有关部门应加快食品安全标准管理体系建设，明确标准制定和整合工作的目标和进度，加快完善食品安全标准体系，为食品安全监管提供健全可靠的技术依据，提高我国食品安全监管的科学化水平。同时建议我国积极参与国际标准的制定和修订工作，及时调整完善食品安全国家标准的内容，使我国的食品安全标准体系既能保障人民群众健康、符合我国实际，又能满足国际贸易的需要。
执法检查组建议，国务院有关部门应加强风险监测能力建设，加快建立覆盖全国的风险监测网络，加快组建国家食品安全风险评估中心，在有能力的地区建立风险评估分中心，健全食品安全风险评估体系，充分发挥风险监测评估对食品安全监管的科学指导作用。
在检查食品安全法实施情况时发现，地方经费投入不足的问题比较突出。执法检查组建议，国务院督促县级以上地方各级政府将食品安全工作纳入国民经济和社会发展计划，将食品安全经费列入财政预算予以保障。
执法检查组强调，当前尤其需要加大风险监测评估、食品安全标准制定、食品安全预警、食品安全事故应急处置、食品安全信息统一发布平台建设等方面的保障力度。
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