世博会前，上海市食品药品监管部门共向园区发放餐饮服务许可证244个，开园期间，检查园内餐饮服务和食品零售单位27560家次，发现并纠正不规范操作行为34072项次，发出监督意见书95份，对发现问题且整改不到位的单位约谈62家次，7家存在明显问题的单位进行了警告。共抽检食品和重点加工环节、温度、消毒效果、个人卫生等14.16万件，发现不合格1.21万件，及时排除了大量安全隐患。截至10月31日闭幕，园区内餐饮服务未发生重大食品安全事故，全市食品安全平稳可控，圆满完成世博会食品安全保障各项工作任务。
世博会期间，上海市坚持举国大协作、大联动、大监管体制，上海世博会组委会、执委会加强统筹协调，国务院食品安全委员会及其成员单位加强配合，跨部门协调小组密切协作，长三角各地、华东地区以及全国各省区市共同构筑起一道井然有序、开阖有度的食品安全保障网络。在园区食品安全保障中，实行了一个部门牵头、各部门通力配合、全过程监管的模式，使世博会食品安全保障工作责任明晰，开展有序，无缝衔接，全程贯通，增强了监管合力，提高了监管效能。园区指挥部和商业服务领导小组两套机制实现了相互衔接和有效运作。
食品安全保障坚持依靠专业化监管队伍，制定审查了数十项保障工作方案，组建了园区200多人的保障工作网络；全面开展了对保障人员、涉博食品经营单位的培训带教，开展了科学细致的世博食品安全突发事件演练和评估。加强了世博食品安全保障关键技术的研究，开展了科学的食品原料安全评估。园区内，根据各片区食品单位的特点，实施了网格化管理，建立了片区企业食品安全档案，开展了错时监管和个性化指导。
上海市食品药品监督管理局以世博食品安全保障为契机，积极开展技术手段的筛选和研制应用工作，建立了现场电子化监管、食品安全溯源、温度实时监控、视频远程监控、快速检测、细菌性食物中毒预警等六大系统。通过这些技术手段在世博会期间的有效运用，大大提升了日常监督检查、关键环节监控、食品安全溯源和快速检测的工作效能，提高了食品安全隐患的发现和识别能力。
世博会期间，食品安全保障首创了供博“中心厨房”（配送中心）保障模式。“中心厨房”既是供博食品保障的坚强后盾，又形成一个新产业链和新业态。从世博会试运行开始，上海市局就把对全市118家“中心厨房”的监督保障作为城市面保障工作的重中之重，及时调整和完善监管策略，实行人防与技防手段的有效结合，实施24小时全程跟班督察，按照加工配送入园食品的品种、方式、数量、管理状况实施分类管理，逐项解决影响食品安全和供应的问题，切实消除可能引发食品安全事件的隐患，实现了供博食品原料来源规范可溯、加工过程安全可控、入园配送严密监控，为园区食品安全筑起了一道坚实的屏障，使供博食品安全得到了有力保障。经过6个来月的严格监管，企业自身管理能力得到进一步增强，食品供应和加工配送正常运转，经受住了梅雨、高温、高湿等不利气候条件和园区满负荷供餐需求的严峻考验，供博食品原料抽检合格率明显上升，总体合格率达97.94%，为园区食品安全和充足供应提供了基本保证，取得了良好的监管成效。
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